У меня такое тоже было.
Снял ручку с водительской двери, соответственно отключил все разъемы на ней, все нормально машина молчала, а на следующий день скинул аккумулятор (порог варил). Подключаю она орет!, все пробовал и зажигание включить и двери открыть, закрыть ни в какую, закончилось тем, что снял разъем с сигналки, машину закрыл и все.
Через пару дней привозят дверную ручку, я ее подключаю, включаю аккум, попробовал сигналку, она молчит, только светодиод на торпеде мигает, вставил ключ в дверь, повернул (не помню точно на закрываение или открывание) он погас и все с тех пор молчит.
Так вот может у тебя там какой разъем отходит! а она думает что с нее двери снимают 

Под капотом на левом водительском фильтре стоит концевик закрытия капота, попробуйте снять с него разьем и поездить без него, если пищать перестанет проблема в этом концевика. В 90% это именно он. Удачи.

если просто снять разъем то ничего не изменится, цепь то разорвана будет. Надо накоротко замыкать провода.

Большинство концевиков в рабочем состоянии разомкнутые. Если закоротить провода сигналка будет думать что капот всегда открыт, соответственно может орать предупреждая.

Проверили на что? 
вообще бредовая идея проверять концевики замыканием. А если с какой-либо стороны замыкание на массу/на + и что вы тогда проверите таким способом? ))

видимо да, я думал вы тоже советуете замкнуть накоротко провод концевика.

Разьем - это грубо вилка с розеткой. На датчике розетка в него воткнута вилка(разьем), его выдергиваете (пусть валяется рядом пару дней) и смотрите как ведет себя машина.